จุลินทรีย์สิ่งมีชีวิตขนาดเล็กที่มองไม่ค่อยเห็นด้วยตาเปล่า และอยู่ใกล้กับเรามาก ๆ จนแทบจะดำเนินชีวิตไปด้วยกันเลย อีกทั้งมีอยู่ในร่างกายเราด้วย จุลินทรีย์เหมือนคนคือต้องการอาหาร และเมื่ออยู่ในที่ที่เหมาะสม ก็ทำให้จุลินทรีย์เจริญเติบโตและออกลูกออกหลานได้ เจ้าจุลินทรีย์ที่มีอยู่ปกติในร่างกายของเราจะเรียกว่า "จุลินทรีย์ประจำถิ่น (Normal Flora)" ส่วนใหญ่จะเป็นพวกเชื้อแบคทีเรีย และอาจพบเชื้อรา ยีสต์ หรือโปรโตซัวบางชนิด
ในร่างกายของเรานั้นมีจุลินทรีย์ประจำถิ่นอาศัยอยู่มากมาย (แบคทีเรียในร่างกายของเรามีมากกว่า 200 ชนิดเลยทีเดียว) โดยมีมาตั้งแต่เราเกิดเลย ตอนที่เราอยู่ในครรภ์มารดานั้นจะไม่มีจุลินทรีย์อยู่เลย และเริ่มมีจุลินทรีย์ขึ้นมาตอนลืมตาออกมาดูโลกแล้วคลอดออกมา